農村土地承包權確權涉及的土地面積大，戶數(shù)多，且農戶承包地塊分散，土地質量差異大，地形不一，空間標記存在困難，確權任務繁重。農村鄉(xiāng)鎮(zhèn)相關工作人員數(shù)量少，登記工作力不從心。同時，由于種種歷史遺留問題，造成承包地塊面積不準、“四至”不清、空間位置不明，給確權工作帶來困難。

由于各村干部及農戶人口變化大，農戶實際耕種的承包地、自留地等土地難以準確區(qū)分類別，容易造成承包地總面積增大，影響了確權面積準確性。又如承包土地時，明確規(guī)定果園地不允許承包，但有的果園地也登記在權證上。1998年農村土地“二輪延包”時，土地是按面積平均發(fā)包到人，由于在不同區(qū)域土質差異大，按照地力肥瘦折扣標準計算后，相同承包人口的家庭，土質差的承包土地面積相對較寬，土質好的承包面積相對少，使得目前確權實測后各戶人均面積不一致，導致按照實測面積據(jù)實確權難以順利推進。

農村土地承包法規(guī)定，擁有該土地的承包權以承包合同為依據(jù)，但存在一些對承包政策操作不規(guī)范，落實不到位的問題，承包臺賬、承包合同、承包權證等檔案資料記載信息不完整、不準確，直接影響土地承包確權的落實。主要表現(xiàn)，一是“二輪延包”時部分農戶土地承包信息登記不準確，位置不明，面積不準。二是在土地多輪流轉、公益設施建設用地占用農田，農戶間互換田地后，卻沒有及時完善相關手續(xù)，造成農戶承包證書上的地塊面積與實際面積不一致的“證地”不符。三是承包臺賬和承包合同中對土地面積等信息記載不相吻合，承包權證沒有以承包合同中的信息登記內容為依據(jù)，而是以臺賬為依據(jù)，造成登記信息不準確。

近年來，隨著國家取消農業(yè)稅、糧食補貼等一系列惠農政策的出臺以及新農村建設土地占用的增加，農村集體土地價值上升，農民對土地確權利益期望增多，在確權過程中承包土地權屬爭議和糾紛漸漸增多。尤其是“二輪延包”遺留問題使得復雜的土地承包糾紛在此次確權落實過程中顯現(xiàn)出來，且目前村委會和鄉(xiāng)鎮(zhèn)經營管理指導站主要承擔基層土地承包經營權糾紛調解，協(xié)調解決難度非常大，影響土地承包確權的落實。農村土地承包法規(guī)定，擁有該土地承包經營權以承包合同為依據(jù)，但實際工作中一些承包合同中土地承包關系信息不清問題引發(fā)土地糾紛相對突出。如實際土地承包經營狀況與發(fā)證情況不相吻合。又如，土地按面積平均發(fā)包到人，由于在不同區(qū)域土質差異大，按照折扣標準計算后，土質差的家庭承包土地面積相對較寬，使得目前確權實測后各戶人均面積不一致，承包面積相對少的農戶則不同意按實有面積確權，只接受按平均實測面積確權，導致?lián)嵈_權難以順利推進。

由于配套機制滯后及土地承包難確權導致土地承包權有償退出難，土地經營權在抵押貸款、銀行融資等方面作用難以得到發(fā)揮。一是尚未建立專業(yè)的土地經營權評估機構。農地經營權價值是金融機構授確定信貸款額度的基礎，而目前專業(yè)的土地經營權價值評估機構和具有專業(yè)資質的評估人員匱缺。二是缺乏真正意義上的土地流轉中介機構和土地仲裁機構，在借款人出現(xiàn)經營風險、缺乏償還能力時，對土地經營權處置帶來一定困難，權屬登記缺乏法律效力，金融機構債權難以得到保護。

針對目前農村承包地確權過程中存在的困難，應把握關鍵環(huán)節(jié)，做細做實，穩(wěn)妥推進。首先，加強宣傳引導，提高確權參與率。創(chuàng)新宣傳方式，著重深入農戶，圍繞廣大農戶關注的問題、利益及時進行政策解釋，消除農戶的顧慮。由各村組選派熟悉當?shù)厍闆r的業(yè)務人員，堅持每塊土地都要“走到、看到、量到、問到”的原則，深入調研，實事求是，在群眾監(jiān)督下實地指導。重點做好發(fā)包方、承包方和承包地塊調查，以農村集體土地所有權確權登記結果為基礎，充分利用先進的測量儀器，查清農戶承包地塊的面積，制作承包地塊分布圖。將調查成果經審核公示確認，作為土地確權的現(xiàn)實依據(jù)，對公示內容有異議的，進行補測核實。

其次，完善檔案資料，確保權屬依據(jù)的完整性。依據(jù)農地承包臺賬、承包合同、承包經營權證書等相關權屬檔案資料進行清查整理，摸清承包地現(xiàn)狀及農戶家庭承包狀況信息。根據(jù)公示確認的調查結果，完善土地承包合同，將完善后的合同作為承包戶取得土地承包權的法定依據(jù)。對沒有簽訂土地承包合同的，要重新簽訂承包合同;對承包合同丟失、殘缺的，進行補簽、完善。對實際承包面積與原土地承包合同、權屬證書記載面積不一致的，要根據(jù)本集體通過的土地承包確權登記頒證方案進行確權。

再次，健全配套機制，提高抵押融資率。一是建立農地價值評估專業(yè)機構。制定農地經營權價值評估管理辦法，引入具有權威性的專業(yè)中介機構和專業(yè)人才對農地經營權抵押價值進行準確評估，合理確定農地價值，為金融機構開展農地經營權抵押貸款創(chuàng)造條件。二是充分履行農地流轉中心和土地仲裁委員會職能，為土地流轉提供合同、法律、競價、糾紛等服務，為農地經營權抵押貸款提供配套服務。

對于土地確權中出現(xiàn)的矛盾糾紛，要本著尊重歷史、注重事實、維護社會穩(wěn)定的原則，積極穩(wěn)妥調解處理。相關部門在處理糾紛矛盾時，要堅持嚴格依法確權，維護群眾利益，從實際出發(fā)，公平、公正地處理確權中出現(xiàn)的各種問題，妥善化解各種矛盾糾紛。對局部性的問題按照“一村一策”或“一事一議”的辦法，具體問題具體分析，通過實行差異化、區(qū)別性的措施，用群眾接受的辦法解決問題。