運輸合同相對于其他合同來說顯得更加的精密與復雜，因為運輸合同涉及大宗貨物的遠距離運輸，在運輸路線、運輸方式、運輸時間、中途貨物損害賠償方面都可能出現糾紛，協商不成就會上法院，運輸合同糾紛管轄法院究竟是運輸地還是到貨地呢？

運輸合同可能是單一的運輸工具來完成，比如由路上運輸或者水上運輸或者空中運輸單獨完成，也有可能采取的是多種運輸工具聯合運輸，路上運輸還存在公路運輸和鐵路運輸之分。

采用不同的運輸工具，就可能形成是由普通法院管轄還是由專門法院管轄的問題。實踐中處理這一問題的基本原則是：

(1)如果是采用單一運輸工具，則按運輸工具不同來確定管轄法院，比如采用水運，則由海事法院管轄，采用鐵路運輸，則由鐵路運輸法院管轄;

(2)如果是采取聯合運輸，根據具體情況，凡是與海事有關的，由海事法院管轄，與鐵路運輸有關的，由鐵路運輸法院管轄;

(3)在聯合運輸中，如果同時存在水運和鐵路運輸的，如何確定管轄法院，法律并未作出具體規定，在這處情況下，可以由當事人選擇法院管轄。

《中華人民共和國民事訴訟法》:

第二十八條因鐵路、公路、水上、航空運輸和聯合運輸合同糾紛提起的訴訟，由運輸始發地、目的地或者被告住所地人民法院管轄。

中華人民共和國海事訴訟特別程序法:

第六條海事訴訟的地域管轄，依照《中華人民共和國民事訴訟法》的有關規定。

下列海事訴訟的地域管轄，依照以下規定：

(一)因海事侵權行為提起的訴訟，除依照《中華人民共和國民事訴訟法》第二十九條至第三十一條的規定以外，還可以由船籍港所在地海事法院管轄;

(二)因海上運輸合同糾紛提起的訴訟，除依照《中華人民共和國民事訴訟法》第二十八條的規定以外，還可以由轉運港所在地海事法院管轄;

(三)因海船租用合同糾紛提起的訴訟，由交船港、還船港、船籍港所在地、被告住所地海事法院管轄;

(四)因海上保賠合同糾紛提起的訴訟，由保賠標的物所在地、事故發生地、被告住所地海事法院管轄;

(五)因海船的船員勞務合同糾紛提起的訴訟，由原告住所地、合同簽訂地、船員登船港或者離船港所在地、被告住所地海事法院管轄;

(六)因海事擔保糾紛提起的訴訟，由擔保物所在地、被告住所地海事法院管轄;因船舶抵押糾紛提起的訴訟，還可以由船籍港所在地海事法院管轄;

(七)因海船的船舶所有權、占有權、使用權、優先權糾紛提起的訴訟，由船舶所在地、船籍港所在地、被告住所地海事法院管轄。

根據上述規定可以看到，運輸合同糾紛管轄法院的判定是按照運輸的方式來劃分的，針對不同的運輸形式，國家設定了不同的管轄法院，包括海事法庭，鐵路法庭等，不論是出發地還是目的地的專門法院都具有管轄權，這也是為了方面審理案件和減少當事人不必要的麻煩。

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