一、貫徹迅速秘密偵查運行機制。這項機制中，兩個因素至關(guān)重要。一要堅持嚴(yán)管線索，確保在秘密中謀劃初查。為防止線索因管理分散而失密，有必要實行檢察長統(tǒng)一管理重大案件線索的工作機制。同時，還應(yīng)建立健全上級院領(lǐng)導(dǎo)管理下級院的案件線索及其處理情況工作機制。上一級院檢察長可以要求下一級院檢察長每月匯報一次案件線索收集處理情況，實現(xiàn)有效整合和充分利用。本院檢察長應(yīng)當(dāng)對有關(guān)線索逐個評估。制定初查方案時，堅持個別交辦、有限知情，嚴(yán)防泄密，嚴(yán)防初查未啟動、說情已上門的現(xiàn)象。二要堅持兵貴神速，爭取在秘密中結(jié)束初查。在初查過程中，應(yīng)當(dāng)堅持先外后內(nèi)，先盡力獲取物證、書證等客觀性證據(jù)，再收集證人證言等主觀性證據(jù)，把直接接觸初查對象放在初查的最后環(huán)節(jié)。一旦啟動初查，必須以快制勝，確保立案或采取強制措施前不走漏任何消息，保障偵查順利進行。

二、健全案件質(zhì)量前瞻后延機制。實踐中，偵查人員時常就一些定罪存在爭議、證據(jù)難以把握的案件向偵監(jiān)、公訴部門咨詢，這種個別化、無序化的咨詢方式不利于職務(wù)犯罪偵查工作的健康發(fā)展。為此，有必要建立健全案件質(zhì)量前瞻后延的工作機制。

一是建立健全案件質(zhì)量前瞻運行機制。從初查開始，偵查部門就要以保障順利起訴、判決的眼光，認(rèn)真全面細(xì)致地收集證據(jù)。批捕起訴部門也要及時提供指導(dǎo)性、針對性意見，要明確偵監(jiān)、公訴部門依法介入的時間和任務(wù)。偵監(jiān)部門立足于法定逮捕條件，對收集、固定、保全證據(jù)提出建議意見，并就事實證據(jù)及法律適用提出意見，審查準(zhǔn)備移送的案卷材料是否齊備。公訴部門立足于法庭舉證要求，從起訴角度，對收集、固定證據(jù)及完善證據(jù)體系等提出建議;審查案卷材料是否齊備、強制措施是否適當(dāng)，并對有關(guān)問題提出改進建議。

二是建立健全偵結(jié)后的質(zhì)量跟蹤機制。偵查部門的視角要向后續(xù)的訴訟階段延伸，負(fù)責(zé)跟蹤協(xié)助出庭公訴，共同補強證據(jù)。建立偵查人員到庭旁聽制度，要求偵查人員樹立庭審意識，在開庭時直觀感受對案件事實和證據(jù)的辯論;判決后，還要對照整套法律文書，認(rèn)真分析判決認(rèn)定事實、采信證據(jù)、適用法律與移送起訴、公訴階段的異同之處，并寫出分析報告，促進偵查質(zhì)量的提高。

三、健全合并偵查機制。鑒于瀆職侵權(quán)與貪污賄賂行為常常交織在一起，為有效懲治職務(wù)犯罪，有必要把反瀆與反貪工作緊密結(jié)合起來，形成偵查合力。一是嘗試通過查清瀆職犯罪，為取得反貪案件的突破掃除障礙。在查辦貪污賄賂犯罪案件時，往往因犯罪隱蔽、偵查手段缺乏、訊問時間限制而難以突破。此時需要及時改變策略，先查瀆職，為反貪鋪路。二是嘗試通過深挖貪污賄賂線索，為實現(xiàn)反瀆案件的突破暗度陳倉。如果僅就瀆職線索查辦瀆職案件，社會理解程度相對較低，法院量刑相對較輕，辦案效果難以提升。為得到更多理解和支持，要不斷擴大反瀆辦案的社會效果，有的市縣區(qū)院通過探索以深挖貪污賄賂犯罪為查辦反瀆案件作“總結(jié)”的聯(lián)合辦案模式，取得了較好的法律效果和社會效果。

四、健全偵查指揮組織領(lǐng)導(dǎo)機制。偵查工作的科學(xué)發(fā)展，需要設(shè)立能夠有效整合辦案資源的偵查指揮組織領(lǐng)導(dǎo)機構(gòu)，從而形成縱向指揮有力、橫向協(xié)作緊密、運轉(zhuǎn)高效有序的工作格局。而分散型模式已不具備在新形勢下實現(xiàn)偵查工作科學(xué)發(fā)展的優(yōu)勢，近年來部分省市縣院就有整合偵查部門的成功實踐。

五、完善內(nèi)部配合協(xié)調(diào)機制。按照分工負(fù)責(zé)與資源整合要求，切實加強職務(wù)犯罪偵查工作中的內(nèi)部協(xié)作協(xié)調(diào)配合機制，增強整體合力。從橫向角度，要堅持舉報中心歸口受理舉報線索，同時由指揮中心負(fù)責(zé)統(tǒng)一管理線索，統(tǒng)一交辦案件，尤其是統(tǒng)一協(xié)調(diào)需要多部門參與辦理的案件。民行檢察部門應(yīng)當(dāng)發(fā)揮熟悉民事行政訴訟規(guī)律的特長，在辦案中發(fā)現(xiàn)司法不公背后的職務(wù)犯罪線索時，可按照規(guī)定進行初查，或根據(jù)檢察長指令移送并配合查辦。監(jiān)所檢察部門查辦案件時要主動爭取反貪、瀆檢部門的支持配合，必要時及時移交反貪、瀆檢部門。

充分發(fā)揮法醫(yī)、理化、文檢、痕檢、司法會計等科技手段在偵查中的作用，有效運用科技手段和現(xiàn)代設(shè)備，固定保全和鑒別證據(jù)，提高自偵工作信息化程度以及科技實力向現(xiàn)實戰(zhàn)斗力轉(zhuǎn)化的能力。從縱向角度，健全以省院為龍頭，各地市縣區(qū)院為支點的檢察系統(tǒng)內(nèi)部配合協(xié)作體制。必要時，對案情重大復(fù)雜、社會反映強烈、需要跨區(qū)域偵查、下級院偵查確有困難或組織偵查不力的大要案，采取組織專項偵查、實施專案偵查、交辦、指定異地管轄、參辦、督辦、提辦等多種偵查指揮方式，發(fā)揮整體優(yōu)勢，排除干擾阻力，有效查辦案件。