一、公司以員工懷孕為由克扣工資怎么辦

職工懷孕后，用人單位非法克扣勞動者的工資，勞動者可以到用人單位所在地的勞動監察部門進行投訴，也可以到用人單位所在地的勞動爭議仲裁委員會申請勞動仲裁。

《勞動合同法》第三十條　用人單位應當按照勞動合同約定和國家規定，向勞動者及時足額支付勞動報酬。用人單位拖欠或者未足額支付勞動報酬的，勞動者可以依法向當地人民法院申請支付令，人民法院應當依法發出支付令。

第五十條　用人單位應當在解除或者終止勞動合同時出具解除或者終止勞動合同的證明，并在十五日內為勞動者辦理檔案和社會保險關系轉移手續。

勞動者應當按照雙方約定，辦理工作交接。用人單位依照本法有關規定應當向勞動者支付經濟補償的，在辦結工作交接時支付。用人單位對已經解除或者終止的勞動合同的文本，至少保存二年備查。

第八十五條　用人單位有下列情形之一的，由勞動行政部門責令限期支付勞動報酬、加班費或者經濟補償;勞動報酬低于當地最低工資標準的，應當支付其差額部分;逾期不支付的，責令用人單位按應付金額百分之五十以上百分之一百以下的標準向勞動者加付賠償金：

(一)未按照勞動合同的約定或者國家規定及時足額支付勞動者勞動報酬的;

(二)低于當地最低工資標準支付勞動者工資的;

(三)安排加班不支付加班費的;

(四)解除或者終止勞動合同，未依照本法規定向勞動者支付經濟補償的。

第七十七條　勞動者合法權益受到侵害的，有權要求有關部門依法處理，或者依法申請仲裁、提起訴訟。

二、克扣工資有什么法律后果

(一)法律后果一：責令改正 賠償

根據《勞動合同法》第八十五條之規定，用人單位未按照勞動合同的約定或者國家規定及時足額支付勞動者勞動報酬的，由勞動行政部門責令限期支付，逾期不支付的，用人單位按應付金額百分之五十以上百分之一百以下的標準向勞動者加付賠償金。勞動者若要獲得此種權利保障，可以向勞動行政部門尋求權利救濟。

(二)法律后果二：合同解除 經濟補償

根據《勞動合同法》第三十八條之規定，用人單位未及時足額支付勞動報酬的，勞動者可以立即解除勞動合同，并且在這種情況下，用人單位需要按照法定標準向勞動者支付經濟補償。勞動者若要獲得此種權利保障，可以向勞動爭議仲裁委員會和人民法院尋求權利救濟。

此外，根據《勞動合同法》第三十條之規定，用人單位拖欠或者未足額支付勞動報酬的，勞動者可以依法向當地人民法院申請支付令，人民法院應當依法發出支付令。

對于懷孕的女職工，用人單位在一般情況下是不能將其辭退，當然這并不代表就一定不能辭退懷孕女職工。根據《勞動合同法》中的規定，若懷孕女職工有特殊情況，比如說有嚴重違紀行為，給用人單位造成了重大經濟損失的，這個時候也是可以將其辭退。

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