第一條　為加強農業專項資金的審計監督工作，提高資金使用效益，促進農業和農村經濟發展，根據《中華人民共和國審計法》和《審計署關于內部審計工作的規定》，結合農業系統實際，特制定本實施辦法。

　　第二條　農業專項資金審計（含審計調查，下同）是農業系統各主管部門審計機構和審計人員適應行業管理的需要，根據國家的有關法規，統一組織對本行業、本系統的專項資金或特定項目的財務收支及其經濟活動的真實性、合法性、合理性、效益性進行監督、評價和鑒證，以促進加強宏觀管理，為部門領導決策服務。

　　農業專項資金審計主要對農業系統（包括農業、畜牧、農墾、水產、農機、鄉鎮企業，下同）主管部門和有關單位管理使用的國家安排用于農業和農村經濟建設的專項撥款，科研、教育、推廣等各種專項資金和利用外資等進行監督。

　　第三條　農業系統專項資金審計實行分級組織實施的辦法。國家安排由農業部管理的專項資金，由農業部統一部署，審計署駐農業部審計局負責組織實施；國家安排由省級農業主管部門管理的專項資金，由省級農業主管部門統一部署，審計機構具體組織實施；由地方政府財政計委等部門安排的專項資金，由地方政府農業主管部門統一部署，省、地（市）、縣農業主管部門審計機構分別組織實施。

　　審計署駐農業部審計局負責組織、指導和監督農業部所屬系統專項資金審計工作。各省（區、市）及計劃單列市級農業主管部門的審計機構負責組織指導本系統、本行業專項資金審計工作。

　　第四條　農業專項資金審計具有政府審計、內部審計雙重職能。省（區、市）各農業主管部門要根據農業部下達的審計任務，組織實施審計監督工作，同時可根據各部門的行業管理要求，安排農業專項資金審計工作。

　　第五條　農業專項資金審計堅持突出重點和加大監督力度的原則，對資金數額大、使用涉及面寬的專項資金要列為監督重點，進行經常性審計；對領導與群眾關注、關系全行業發展的專項資金，要進行重點審計；對投資較多、工程規模較大、期限較長的重點建設項目資金，要加強監督和進行后續（跟蹤）審計。

　　第六條　農業主管部門對農業專項資金審計要加強領導、督促和檢查工作，有關部門和單位要協同配合，人員組合符合審計工作需要。

　　第七條　農業專項資金審計的主要內容。

　　（一）國家計劃內投資、中央財政預算安排（包括主管部門）下撥的專項資金、地方財政配套資金是否按國家規定及時足額撥付到位。

　　（二）項目資金投向是否合理，資金使用是否合規合法、專款專用，有無擠占、挪用、截留、轉移、損失浪費等問題。

　　（三）建設項目計劃（協議）執行與完成情況，有無擅自變更項目計劃，有無超計劃、超標準、超面積、超預算、隨意搞計劃外工程等問題。

　　（四）專項資金使用單位財務管理和內控制度是否健全有效，會計核算是否規范，各項報表是否齊全、合規、真實、準確。

　　（五）農業專項資金使用的經濟效益、社會效益、生態效益情況。

　　第八條　農業專項資金審計要統一審計項目、統一審計內容、統一審計方法、統一審計指標。審計方式一般為就地審計。

　　第九條　農業專項資金審計的主要程序。

　　（一）全國農業系統的農業專項資金審計由審計署駐農業部審計局列入年度審計項目計劃，經審計署批準，農業部下達審計任務。地方農業主管部門根據農業部和上級主管部門下達的任務，擬定本部門專項資金審計工作計劃，制定工作方案，發出審計通知書，培訓審計人員，派出審計組，實施審計監督工作。

　　（二）聽取被審單位專項資金管理使用情況匯報，審查賬目、憑證、報表、實物，進行實地察看及進行必要的審計調查取證。

　　（三）被審單位要積極配合，提供所需的賬目、文件、資料，接受查詢和提供必要的工作條件。

　　（四）評價資金使用效益，對審計中發現的問題提出處理意見和改進建議。

　　（五）審計終結出具審計報告。審計報告內容應當真實、客觀、公正，全面反映專項資金到位情況、項目建設情況、資金使用效果和審計處理意見等，不得隱瞞或虛報。審計報告須征求被審單位意見。

　　農業部組織實施的專項資金審計，審計署駐農業部審計局根據需要進行抽審，在審計項目完成后根據各省、區、市農業主管部門上報的審計報告寫出綜合審計報告，報農業部領導審定后印發各省有關農業主管部門，并抄送國務院有關部門和省、區、市人民政府。地方農業主管部門組織實施的專項資金審計，由主管部門領導審批后下達審計意見書或審計決定，抄報本級人民政府、上級農業主管部門和同級審計機關。

　　（六）被審單位必須執行經批準的審計意見書和審計決定。對審計意見書或審計決定如有異議，可在10日內將其書面意見送交負責專項資金審計的主管部門，主管部門領導應及時進行處理，在規定時間內作出是否復審的決定。

　　（七） 審計機構要對審計查出問題較多的單位，在下達審計意見書或審計決定后對其實施后續（跟蹤）審計，檢查采納審計意見和執行審計決定的情況，并將結果報本級人民政府、主管部門和審計機關。

　　（八）農業專項資金審計結束，對辦理的審計事項及時建立審計檔案，按照規定進行管理。

　　第十條　農業專項資金審計的依據。

　　（一）國家的法律、法規、政策。

　　（二）農業部、地方人民政府和主管部門在法定權限范圍內制定的各項規章制度。

　　（三）上級主管部門和國家投資部門下達的投資計劃，建設單位與上級主管部門和國家投資部門簽訂的協議（合同），經批準的建設項目設計任務書等有關文件、資料。

　　第十一條　農業系統審計機構和審計人員在農業專項資金審計中的主要職權。

　　（一）了解建設項目研究、論證、立項等有關情況和參加有關會議。

　　（二）要求有關部門提供有關文件資料及工作條件，積極給予配合。

　　（三）檢查會計憑證、賬冊、報表等核算資料和資產，被審單位不得拒絕。

　　（四）就審計中的有關事項進行調查并索取證明材料。

　　（五）對審計中發現的違反財經法紀問題，依照審計署、國家計委等六部委制定的《建設項目審計處理暫行規定》（審投發［1996］105號）和有關政策法規提出處理意見和建議。

　　（六）對配套資金不到位的，督促其限期到位；對擠占挪用的資金責成有關各部門和單位限期歸還原資金渠道 ；對應當上繳的罰沒款項，監督其及時上繳。

　　（七）對配套資金限期內不到位的，擠占挪用專項資金限期不歸還原資金渠道的，可建議有關部門停撥款項或不予安排鞏固提高項目和新建項目。

　　（八）對嚴重違反財經法規、嚴重損失浪費的直接責任人員，向有關部門領導提出處理建議，并按有關規定向上級審計機關反映。

　　（九）向建設項目單位所在人民政府或上級主管部門如實報告審計情況。

　　第十二條　審計人員辦理審計事項要嚴格執行審計工作制度和審計人員守則，遵守職業道德。

　　第十三條　凡是國家安排有農業專項資金的省（區、市）及計劃單列市級農業主管部門，應當建立健全審計制度，加強對專項資金的審計監督工作。國家安排農業專項資金數額大的市、縣農業部門，應當建立內部審計制度，加強對專項資金的審計監督工作。

　　第十四條　農業專項資金建設工程項目必須經審計后進行驗收。凡列入審計項目計劃而未經審計，或審計不合要求的，主管部門有權不再受理申報新的投資項目。

　　第十五條　農業專項資金審計所需經費，按照《中華人民共和國審計法》規定，由各級政府主管部門給以保證。

　　第十六條　各省（區、市）農業部門可根據本實施辦法，結合各地區實際，制定實施細則。

　　第十七條　本辦法由中華人民共和國農業部負責解釋。

　　第十八條　本辦法自發布之日起執行。農業部（1990）農（審）字4號《農業系統行業審計實施辦法》同時廢止。