隨著我國經濟體制改革的深化，高等教育體制也必須相應地改革。改革的重要方面是逐步理順政府與學校之間的關系，轉變政府職能，擴大學校辦學自主權，確立學校的法人地位，進一步明確學校的權利和義務、利益和責任。以利于增強學校的辦學活力，主動適應和服務于經濟建設和衛生事業發展的需要。根據國務院1986年發布的《高等教育管理職責暫行規定》中確定的高校管理權限，參照國家教委有關文件，結合當前部屬高校的實際，現提出擴大衛生部直屬高校辦學自主權的意見。

　　一、學校可根據學科發展和社會需要的變化，在學校現設置的本、專科專業內確定與調整專業方向；設置、調整與現有本科專業相近的專科專業。上述專業變動報衛生部備案。本科專業的增設與撤銷仍需報衛生部審批。

　　二、學校可適當擴大調節性招生計劃的比例，可在年度本、專科招生計劃總數的25％以內招收委托培養和自費生。委托培養生和自費生比例可打通使用。學校招收自費生需征得地方同意。衛生部不因此減少事業費撥款。

　　三、學校在辦學條件允許的前提下，可依據國家經濟建設和衛生事業發展需要，在衛生部核定的年度本、專科招生計劃總數的基礎上增招5％的委托培養和自費生。增招計劃外自費生亦需征得地方同意。學校接受地方劃轉的本、專科委托培養招生計劃，為地方培養人才，仍須由衛生部批準。

　　四、學校可在年度研究生招生計劃數內，根據實際情況調整招收在職和定向研究生的比例；學校在辦學條件允許的前提下，可依據社會需要，適當招收符合國家錄取標準的計劃外委托培養、學校自籌經費研究生和自費研究生，國家不負責安排工作。

　　五、學校可依據國家經濟建設和衛生事業發展需求，在不增加國家事業編制和科學事業費的前提下，根據學校所承擔的科研任務，可自行確定和調整校內科研機構、專職科研編制和科研課題，創辦科技產業實體。

　　六、學校可依據社會需要舉辦多種形式和層次的繼續教育及崗位培訓等非學歷教育；成人高等學歷教育在辦學條件允許和適當提高錄取標準的前提下，可在年度招生計劃數的20％以內增加計劃外招生人數。

　　七、在基建投資總額包干的前提下，經衛生部批準授權，學校可以根據批準的設計任務書自行審定生活用房及部分教學用房的設計文件。學校可利用自籌資金適當調整建房標準，有條件的學校可利用貸款解決某些基建項目的急需。

　　八、學校可根據辦學實際需要和學校所在地經濟發展與群眾收入水平，提出年度學雜費和委培生、自費生等收費的標準，報衛生部核批。

　　九、學校按照“包干使用，超支不補，結余留用，自主平衡”的經費預算原則以及有關法規，自主編籌安排使用學校的預算內事業費和預算外經費。

　　十、學校在執行國家工資法規和實行工資總額包干的前提下，有權確定適合本校實際的校內分配辦法和津貼標準。在國家核定的工資總額內，因精簡人員提高效益而結余的工資總額，可同學校自有資金合并用于提高校內津貼標準，用于校內津貼部分不計作獎金。

　　十一、學校有權依據校內各方面承擔的任務和工作性質不同，選擇不同的用人制度和管理體制。有權在國家核定的編制總數內，確定校內各類人員的構成比例。在不增加國家投入的前提下，學校可根據事業發展需要，增設部分流動編制，根據校辦產業發展的需要，設立企業編制。

　　十二、學校有權依據教學、科研任務和師資隊伍建設的需要，設置和調整專業技術職務崗位，有權依據有關規定自主進行專業技術職務評聘工作。有教授審定權的學校可自主聘請名譽教授，報衛生部備案。

　　十三、學校有權依據實際需要確定校內機構的設置及其人員的配備，除中央和國務院有明確規定必須設置的機構以外，可不參照主管部門對口設置校內機構。

　　十四、學校可按有關規定、提名并考察副校級干部人選，報衛生部批準任免。

　　十五、學校可根據衛生部的委托和有關規定，由黨委書記和校長代行審批出國留學人員；代行審批副校長以下出國進行合作科研、參加國際會議以及校際交流等活動的人員：代行審批來華講學的外籍人員。

　　十六、在國家分配下達的來華留學生經費及來華留學生計劃指標內，承擔外國留學生培養任務的學校可直錄取來華留學生：在辦學條件允許的前提下，可直接招收錄取自費來華留學生，并規定其學費標準。

　　在擴大部屬高校辦學自主權的同時，學校要轉變觀念和做法，充分發揮主動性和創造性，實現權限與職責的統一：學校要建立健全校內管理規章制度和審議、監督、考核、評估制度，形成自我發展和自我約束的良性循環。在實施擴大辦學自主權的過程中，學校要積極主動爭取當地政府的領導和支持，注意與社會其他方面的改革相互協調，逐步形成國家宏觀管理和高等學校自主辦學相結合的運行機制，促進教學、科研和醫療服務水平的全面提高。